<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Journal of Experimental and Clinical Surgery</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Journal of Experimental and Clinical Surgery</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Вестник экспериментальной и клинической хирургии</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2070-478X</issn><issn publication-format="electronic">2409-143X</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Voronezh State Medical University named after N.N. Burdenko</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">1634</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.18499/2070-478X-2022-15-4-314-322</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные статьи</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Diagnostic Options for Postoperative Complications in Surgery</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Способ диагностики послеоперационных осложнений в хирургии</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1070-6029</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Solomakh</surname><given-names>Anatoly Anatolyevich</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Соломаха</surname><given-names>Анатолий Анатольевич</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Doctor of Technical Sciences, Professor, Head of the Department of Computer Technology</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>хирург, трансфузиолог, врач высшей категории, к.м.н., доцент, действительный член Российской академии медико-технических наук, оказывал медицинскую помощь больным, осуществил сбор и обработку данных больных, подготовил базу данных, которая имеет номер государственной регистрации в Роспатенте. Разработал концепцию и дизайн исследования совместно с Горбаченко В. И, принимал участие в написании рукописи статьи, редактировании. </p></bio><email>anatoly.solomakha@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-1012-8855</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1045-0906</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Gorbachenko</surname><given-names>Vladimir Ivanovich</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Горбаченко</surname><given-names>Владимир Иванович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Ph.D., surgeon, transfusiologist, doctor of the highest category, associate professor, full member of the Russian Academy of Medical and Technical Sciences</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д.т.н., профессор, заведующий кафедрой «Компьютерные технологии», разрабатывал концепцию и дизайн исследования, принимал участие в подготовке базы данных, занимался статистической обработкой данных, нейросетевым моделированием, принимал участие в написании рукописи статьи, её редактировании</p></bio><email>anatoly.solomakha@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff2"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Penza State University,</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Пензенский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации</institution></aff></aff-alternatives><aff-alternatives id="aff2"><aff><institution xml:lang="en">Penza State University</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Пензенский государственный университет» Министерства науки и высшего образования Российской Федерации</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2022-12-31" publication-format="electronic"><day>31</day><month>12</month><year>2022</year></pub-date><volume>15</volume><issue>4</issue><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>314</fpage><lpage>322</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2022-08-01"><day>01</day><month>08</month><year>2022</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2022, Voronezh N.N. Burdenko State Medical University</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2022, ФГБОУ ВО ВГМУ им. Н.Н. Бурденко Минздрава России</copyright-statement><copyright-year>2022</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Voronezh N.N. Burdenko State Medical University</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">ФГБОУ ВО ВГМУ им. Н.Н. Бурденко Минздрава России</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://vestnik-surgery.com/journal/about/editorialPolicies</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://vestnik-surgery.com/journal/article/view/1634">https://vestnik-surgery.com/journal/article/view/1634</self-uri><abstract xml:lang="en"><p>Currently, scientific research is usually carried out in accordance with the postulates of evidence-based medicine in Russia and foreign countries. However, the implementation of these principles requires deep knowledge of surgery and mathematical modeling. Authors: a surgeon and a programmer developed mathematical models involved in the diagnosis of postoperative complications in surgery. In this paper, we investigated a deep, fully connected neural network for the diagnosis of postoperative complications on the clinical example of acute appendicitis. As a training set of parameters, we used a set developed by the authors on the basis of real clinical data, which has a state registration number in the form of a database, and includes a knowledge base. The interquantile range of the F1 measure is proposed for the selection of significant features. An approach to coding composite categorical features, characterized by a compact representation, is proposed. For pre-processing of training data, it is proposed to use a step-up autoencoder. The autoencoder converts the selected functions into a higher-dimensional space, which, according to Kover's theorem, facilitates the classification of features. The neural network is implemented using the Keras and TensorFlow libraries. To train the neural network, the Adam algorithm with adaptive learning speed is used. To reduce the effect of overfitting, a modern regularization method — dropout-was used. The analysis and selection of the classifier quality metrics are carried out. To evaluate the characteristics of the neural network, k-block cross-validation was used. The trained neural network showed high diagnostic performance on the test data set.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p>В России и зарубежных странах научные исследования в хирургии принято выполнять в соответствии с постулатами доказательной медицины. Однако реализация этих принципов требует глубоких знаний хирургии и математического моделирования. Авторы: хирург и программист в области машинного обучения разработали математические модели, участвующие в диагностике послеоперационных осложнений в хирургии. В данной работе исследована глубокая полносвязная нейронная сеть для диагностики послеоперационных осложнений на клиническом примере острого аппендицита. В качестве обучающего множества параметров использовался набор, разработанный авторами на основе реальных клинических данных, имеющий номер государственной регистрации в виде базы данных. Для выбора значимых признаков предложен подход на межквантильном размахе F1-меры и к кодированию составных категориальных признаков, отличающийся компактным представлением. Для предварительной обработки обучающих данных предлагается использовать повышающий автоэнкодер. Автоэнкодер преобразует выбранные признаки в пространство более высокого измерения, что, согласно теореме Ковера, облегчает классификацию признаков. Глубокая нейронная сеть реализована с использованием библиотек Keras и TensorFlow. Для обучения нейросети применен алгоритм Adam с адаптивной скоростью обучения. Для снижения эффекта переобучения использован современный метод регуляризации — dropout. Проведены анализ и выбор метрик качества классификатора. Для оценки характеристик нейросети использована кросс-валидация по k блокам. Обученная нейронная сеть показала высокие диагностические показатели на тестовом наборе данных. </p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>medical diagnostics</kwd><kwd>postoperative complications</kwd><kwd>deep neural networks</kwd><kwd>selection of informative features</kwd><kwd>neural network training</kwd><kwd>retraining</kwd><kwd>increasing autoencoder</kwd><kwd>evidence-based medicine</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>медицинская диагностика</kwd><kwd>послеоперационные осложнения</kwd><kwd>глубокие нейронные сети</kwd><kwd>отбор информативных признаков</kwd><kwd>обучение нейронной сети</kwd><kwd>переобучение</kwd><kwd>повышающий автоэнкодер</kwd><kwd>доказательная медицина</kwd></kwd-group><funding-group/></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>Совцов С. А. Острый аппендицит: что изменилось в начале нового века?(с комментарием).Хирургия. Журнал им. Н. П. Пирогова.2013;7:37–42.</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Simillis C, Symeonides P, Shorthouse AJ, Tekkis PP. A meta-analysis comparing conservative treatment versus acute appendectomy for complicated appendicitis (abscess or phlegmon).Surgery.2010;147:818–829.doi.org/10.1016/s0090-3671(10)79895-5</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Prabhudesai SG.  Artificial neural Networks: Useful Aid in Diagnosing Acute Appendicitis.World Journal of Surgery.2008; 2:305–309.doi.org/10.1007/s00268-007-9299-5</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Park SY, Kim SM. Acute appendicitis diagnosis using artificial neural networks.Technology and health care.2015;23:559–565.doi.org/10.3233/thc-150994</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Juliano Y, Rosa OM, Novo NF, Favaro ML. Risk factors associated with complications of acute appendicitis.Journal of Brazilian College of Surgeons.2017;6:560–566.doi.org/10.26226/morressier.58fa1765d462b80290b50f65</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Bakti N, Hussain A, El-Hassani S. A rare complication of acute appendicitis: Superior mesenteric vein thrombosis.International Journal of Surgery Case Reports. 2011; 8: 250–252.doi.org/10.1016/j.ijscr.2011.08.003</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Brigham KL, Johns MME. Predictive Health: How We Can Reinvent Medicine to Extend Our Best Years.Basic Books.2012; 256.</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Miner L, Bolding P, Hilbe J. Practical Predictive Analytics and Decisioning Systems for Medicine: Informatics Accuracy and Cost-Effectiveness for Healthcare Administration and Delivery Including Medical Research. Academic Press.2014;1110.</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Joskowicz L. Computer-aided surgery meets predictive, preventive, and personalized medicine. EPMA Journal.2017;8:1–4. doi.org/10.1007/s13167-017-0084-8</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Хайкин С. Нейронные сети: полный курс. М.: Вильямс.2006;1104.</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Гудфеллоу Я., Бенджио И., Курвиль А. Глубокое обучение.М.: ДМК Пресс, 2018.652с. </mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Аггарвал Ч. Нейронные сети и глубокое обучение.СПб.: ООО "Диалектика".2020;752.</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>П. А. Ващенко, А. А. Соломаха, В. И. Горбаченко, А. О. Хазратов. Клинико-лабораторные параметры больных острым аппендицитом. Свидетельство о государственной регистрации базы данных № 2014621431. Дата государственной регистрации в Реестре баз данных 10 октября 2014 г.</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Zheng A, Casari A. Feature Engineering for Machine Learning: Principles and Techniques for Data Scientists. O'Reilly Media. 2018; 218.</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Chandrashekar G, Sahin F. A survey on feature selection methods.Computers &amp; Electrical Engineering.2014;40: 1: 16–28.doi.org/10.1016/j.compeleceng.2013.11.024</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Брюс П., Брюс Э. Практическая статистика для специалистов DataScience. СПб.: БХВ Петербург. 2018;304.</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Жерон О. Прикладное машинное обучение с помощью Scikit‑Learn, Keras и TensorFlow: концепции, инструменты и техники для создания интеллектуальных систем. СПб.: ООО "Диалектика".2020;1040.</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Brownlee J. Why One-Hot Encode Data in Machine Learning? https://machinelearningmastery.com/why-one-hot-encode-data-in-machine-learning/</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Хейдт М., Груздев А. В. Изучаем pandas.М.: ДМК Пресс.2019;682.</mixed-citation></ref><ref id="B20"><label>20.</label><mixed-citation>Scikit-Learn // https://scikit-learn.org/stable/</mixed-citation></ref><ref id="B21"><label>21.</label><mixed-citation>Шолле Ф. Глубокое обучение на Python. СПб.: Питер.2018; 400.</mixed-citation></ref><ref id="B22"><label>22.</label><mixed-citation>Keras: The Python Deep Learning library. Usage of callbacks. https://keras.io/callbacks/</mixed-citation></ref><ref id="B23"><label>23.</label><mixed-citation>Cover TM. Geometrical and Statistical Properties of Systems of Linear inequalities with Applications in Pattern Recognition.IEEE Transactions on Electronic Computers. 1965; EC14: 3: 326–334.doi.org/10.1109/pgec.1965.264137</mixed-citation></ref><ref id="B24"><label>24.</label><mixed-citation>Zeiler MD. ADADELTA: An Adaptive Learning Rate Method. 2012; https://arxiv.org/abs/1212.5701</mixed-citation></ref><ref id="B25"><label>25.</label><mixed-citation>Рашка С., Мирджалили В. Python и машинное обучение: машинное и глубокое обучение с использованием Python, scikit-learn и TensorFlow 2. СПБ.: ООО "Диалектика".2020;848.</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
